Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
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