Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms