Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA3Q9Y6H8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms