Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms