Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD5Q9P267 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms