Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms