Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms