Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG2BQ96BY7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG2BQ96BY7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms