Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLA-CQ95604 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms