Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Stx5Q8K1E0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms