Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
INTS3Q68E01 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms