Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms