Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms