Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms