Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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GPNMBQ14956 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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GPNMBQ14956 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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GPNMBQ14956 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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GPNMBQ14956 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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GPNMBQ14956 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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GPNMBQ14956 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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