Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MKRN4PQ13434 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
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