Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME3Q13232 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME3Q13232 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME3Q13232 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME3Q13232 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME3Q13232 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME3Q13232 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME3Q13232 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NME3Q13232 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME3Q13232 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NME3Q13232 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME3Q13232 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME3Q13232 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME3Q13232 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME3Q13232 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME3Q13232 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME3Q13232 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME3Q13232 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NME3Q13232 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME3Q13232 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME3Q13232 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME3Q13232 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME3Q13232 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME3Q13232 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME3Q13232 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME3Q13232 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NME3Q13232 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME3Q13232 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME3Q13232 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME3Q13232 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME3Q13232 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms