Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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