Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAP1Q01518 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms