Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms