Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC4P35249 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC4P35249 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC4P35249 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC4P35249 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC4P35249 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC4P35249 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC4P35249 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC4P35249 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC4P35249 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC4P35249 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC4P35249 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC4P35249 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC4P35249 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC4P35249 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC4P35249 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC4P35249 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC4P35249 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC4P35249 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC4P35249 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC4P35249 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC4P35249 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC4P35249 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC4P35249 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RFC4P35249 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
RFC4P35249 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC4P35249 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC4P35249 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC4P35249 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC4P35249 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC4P35249 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC4P35249 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RFC4P35249 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC4P35249 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC4P35249 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC4P35249 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC4P35249 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC4P35249 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC4P35249 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC4P35249 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RFC4P35249 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC4P35249 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RFC4P35249 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFC4P35249 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RFC4P35249 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFC4P35249 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC4P35249 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC4P35249 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms