Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPS1P31327 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPS1P31327 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPS1P31327 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPS1P31327 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPS1P31327 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPS1P31327 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPS1P31327 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPS1P31327 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPS1P31327 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPS1P31327 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPS1P31327 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPS1P31327 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CPS1P31327 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CPS1P31327 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPS1P31327 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPS1P31327 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPS1P31327 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPS1P31327 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CPS1P31327 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPS1P31327 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPS1P31327 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPS1P31327 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPS1P31327 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPS1P31327 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPS1P31327 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPS1P31327 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPS1P31327 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPS1P31327 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPS1P31327 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPS1P31327 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CPS1P31327 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPS1P31327 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPS1P31327 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CPS1P31327 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CPS1P31327 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPS1P31327 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPS1P31327 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPS1P31327 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CPS1P31327 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPS1P31327 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPS1P31327 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPS1P31327 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPS1P31327 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CPS1P31327 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CPS1P31327 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CPS1P31327 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CPS1P31327 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CPS1P31327 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CPS1P31327 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPS1P31327 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPS1P31327 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPS1P31327 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPS1P31327 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CPS1P31327 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPS1P31327 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CPS1P31327 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CPS1P31327 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPS1P31327 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPS1P31327 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPS1P31327 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPS1P31327 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPS1P31327 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CPS1P31327 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPS1P31327 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPS1P31327 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CPS1P31327 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPS1P31327 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPS1P31327 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPS1P31327 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPS1P31327 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPS1P31327 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPS1P31327 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPS1P31327 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPS1P31327 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPS1P31327 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPS1P31327 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPS1P31327 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPS1P31327 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPS1P31327 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPS1P31327 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPS1P31327 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPS1P31327 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPS1P31327 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPS1P31327 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPS1P31327 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPS1P31327 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms