Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMOD1P29536 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms