Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRGP23470 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
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