Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP1P09874 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP1P09874 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP1P09874 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP1P09874 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP1P09874 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP1P09874 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP1P09874 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP1P09874 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP1P09874 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PARP1P09874 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PARP1P09874 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PARP1P09874 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PARP1P09874 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP1P09874 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP1P09874 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP1P09874 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP1P09874 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP1P09874 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP1P09874 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP1P09874 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP1P09874 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP1P09874 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP1P09874 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP1P09874 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP1P09874 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP1P09874 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP1P09874 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP1P09874 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP1P09874 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP1P09874 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP1P09874 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP1P09874 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP1P09874 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP1P09874 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP1P09874 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP1P09874 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP1P09874 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP1P09874 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP1P09874 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP1P09874 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP1P09874 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP1P09874 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP1P09874 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP1P09874 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP1P09874 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP1P09874 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP1P09874 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP1P09874 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP1P09874 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP1P09874 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP1P09874 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP1P09874 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP1P09874 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP1P09874 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP1P09874 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms