Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm5114W4VSN8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm5114W4VSN8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gm5114W4VSN8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm5114W4VSN8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm5114W4VSN8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm5114W4VSN8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm5114W4VSN8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm5114W4VSN8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm5114W4VSN8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm5114W4VSN8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm5114W4VSN8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm5114W4VSN8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm5114W4VSN8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm5114W4VSN8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm5114W4VSN8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm5114W4VSN8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm5114W4VSN8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm5114W4VSN8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm5114W4VSN8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm5114W4VSN8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm5114W4VSN8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm5114W4VSN8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm5114W4VSN8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm5114W4VSN8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm5114W4VSN8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm5114W4VSN8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm5114W4VSN8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm5114W4VSN8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm5114W4VSN8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm5114W4VSN8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm5114W4VSN8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm5114W4VSN8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm5114W4VSN8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gm5114W4VSN8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms