Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptgdr2Q9Z2J6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptgdr2Q9Z2J6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptgdr2Q9Z2J6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptgdr2Q9Z2J6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptgdr2Q9Z2J6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptgdr2Q9Z2J6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptgdr2Q9Z2J6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptgdr2Q9Z2J6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptgdr2Q9Z2J6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptgdr2Q9Z2J6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptgdr2Q9Z2J6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptgdr2Q9Z2J6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptgdr2Q9Z2J6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptgdr2Q9Z2J6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptgdr2Q9Z2J6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptgdr2Q9Z2J6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptgdr2Q9Z2J6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptgdr2Q9Z2J6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptgdr2Q9Z2J6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptgdr2Q9Z2J6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptgdr2Q9Z2J6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ptgdr2Q9Z2J6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ptgdr2Q9Z2J6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptgdr2Q9Z2J6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptgdr2Q9Z2J6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms