Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn6Q9Z262 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn6Q9Z262 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn6Q9Z262 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn6Q9Z262 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn6Q9Z262 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn6Q9Z262 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn6Q9Z262 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn6Q9Z262 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn6Q9Z262 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn6Q9Z262 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn6Q9Z262 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn6Q9Z262 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn6Q9Z262 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn6Q9Z262 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn6Q9Z262 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn6Q9Z262 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn6Q9Z262 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn6Q9Z262 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn6Q9Z262 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn6Q9Z262 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn6Q9Z262 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn6Q9Z262 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn6Q9Z262 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn6Q9Z262 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn6Q9Z262 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn6Q9Z262 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn6Q9Z262 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn6Q9Z262 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn6Q9Z262 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn6Q9Z262 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn6Q9Z262 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn6Q9Z262 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn6Q9Z262 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn6Q9Z262 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms