Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfrp4Q9Z1N6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfrp4Q9Z1N6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfrp4Q9Z1N6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms