Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cog1Q9Z160 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cog1Q9Z160 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cog1Q9Z160 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cog1Q9Z160 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cog1Q9Z160 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cog1Q9Z160 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cog1Q9Z160 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cog1Q9Z160 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cog1Q9Z160 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cog1Q9Z160 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cog1Q9Z160 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cog1Q9Z160 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cog1Q9Z160 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cog1Q9Z160 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Cog1Q9Z160 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cog1Q9Z160 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cog1Q9Z160 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cog1Q9Z160 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cog1Q9Z160 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cog1Q9Z160 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cog1Q9Z160 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cog1Q9Z160 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cog1Q9Z160 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cog1Q9Z160 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cog1Q9Z160 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cog1Q9Z160 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cog1Q9Z160 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cog1Q9Z160 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cog1Q9Z160 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog1Q9Z160 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog1Q9Z160 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog1Q9Z160 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog1Q9Z160 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog1Q9Z160 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog1Q9Z160 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cog1Q9Z160 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cog1Q9Z160 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms