Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z109

Vsig2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig2Q9Z109 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vsig2Q9Z109 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vsig2Q9Z109 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vsig2Q9Z109 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vsig2Q9Z109 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vsig2Q9Z109 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vsig2Q9Z109 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vsig2Q9Z109 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vsig2Q9Z109 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vsig2Q9Z109 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vsig2Q9Z109 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vsig2Q9Z109 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vsig2Q9Z109 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vsig2Q9Z109 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsig2Q9Z109 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms