Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cyp46a1Q9WVK8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cyp46a1Q9WVK8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cyp46a1Q9WVK8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cyp46a1Q9WVK8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cyp46a1Q9WVK8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cyp46a1Q9WVK8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cyp46a1Q9WVK8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cyp46a1Q9WVK8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cyp46a1Q9WVK8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cyp46a1Q9WVK8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cyp46a1Q9WVK8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Cyp46a1Q9WVK8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cyp46a1Q9WVK8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cyp46a1Q9WVK8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cyp46a1Q9WVK8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cyp46a1Q9WVK8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cyp46a1Q9WVK8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cyp46a1Q9WVK8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cyp46a1Q9WVK8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cyp46a1Q9WVK8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cyp46a1Q9WVK8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cyp46a1Q9WVK8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cyp46a1Q9WVK8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp46a1Q9WVK8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp46a1Q9WVK8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cyp46a1Q9WVK8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cyp46a1Q9WVK8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cyp46a1Q9WVK8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cyp46a1Q9WVK8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cyp46a1Q9WVK8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cyp46a1Q9WVK8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cyp46a1Q9WVK8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cyp46a1Q9WVK8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cyp46a1Q9WVK8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cyp46a1Q9WVK8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cyp46a1Q9WVK8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cyp46a1Q9WVK8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cyp46a1Q9WVK8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cyp46a1Q9WVK8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cyp46a1Q9WVK8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cyp46a1Q9WVK8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cyp46a1Q9WVK8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cyp46a1Q9WVK8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyp46a1Q9WVK8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cyp46a1Q9WVK8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp46a1Q9WVK8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp46a1Q9WVK8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp46a1Q9WVK8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp46a1Q9WVK8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp46a1Q9WVK8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp46a1Q9WVK8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cyp46a1Q9WVK8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cyp46a1Q9WVK8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cyp46a1Q9WVK8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cyp46a1Q9WVK8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Cyp46a1Q9WVK8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cyp46a1Q9WVK8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cyp46a1Q9WVK8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cyp46a1Q9WVK8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cyp46a1Q9WVK8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp46a1Q9WVK8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp46a1Q9WVK8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp46a1Q9WVK8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyp46a1Q9WVK8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyp46a1Q9WVK8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp46a1Q9WVK8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp46a1Q9WVK8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp46a1Q9WVK8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp46a1Q9WVK8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp46a1Q9WVK8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cyp46a1Q9WVK8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cyp46a1Q9WVK8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms