Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVJ9

Efemp2, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp2Q9WVJ9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efemp2Q9WVJ9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efemp2Q9WVJ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efemp2Q9WVJ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efemp2Q9WVJ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efemp2Q9WVJ9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efemp2Q9WVJ9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efemp2Q9WVJ9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efemp2Q9WVJ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Efemp2Q9WVJ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Efemp2Q9WVJ9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efemp2Q9WVJ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efemp2Q9WVJ9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efemp2Q9WVJ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efemp2Q9WVJ9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efemp2Q9WVJ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efemp2Q9WVJ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efemp2Q9WVJ9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efemp2Q9WVJ9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efemp2Q9WVJ9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efemp2Q9WVJ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efemp2Q9WVJ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efemp2Q9WVJ9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efemp2Q9WVJ9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efemp2Q9WVJ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efemp2Q9WVJ9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efemp2Q9WVJ9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efemp2Q9WVJ9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efemp2Q9WVJ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efemp2Q9WVJ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efemp2Q9WVJ9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efemp2Q9WVJ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Efemp2Q9WVJ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efemp2Q9WVJ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efemp2Q9WVJ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efemp2Q9WVJ9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efemp2Q9WVJ9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Efemp2Q9WVJ9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efemp2Q9WVJ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efemp2Q9WVJ9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efemp2Q9WVJ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efemp2Q9WVJ9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Efemp2Q9WVJ9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Efemp2Q9WVJ9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Efemp2Q9WVJ9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Efemp2Q9WVJ9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efemp2Q9WVJ9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efemp2Q9WVJ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Efemp2Q9WVJ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efemp2Q9WVJ9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Efemp2Q9WVJ9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efemp2Q9WVJ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efemp2Q9WVJ9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efemp2Q9WVJ9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efemp2Q9WVJ9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efemp2Q9WVJ9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efemp2Q9WVJ9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efemp2Q9WVJ9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efemp2Q9WVJ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efemp2Q9WVJ9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efemp2Q9WVJ9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efemp2Q9WVJ9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efemp2Q9WVJ9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efemp2Q9WVJ9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efemp2Q9WVJ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efemp2Q9WVJ9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efemp2Q9WVJ9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efemp2Q9WVJ9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efemp2Q9WVJ9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efemp2Q9WVJ9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Efemp2Q9WVJ9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efemp2Q9WVJ9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms