Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Carm1Q9WVG6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Carm1Q9WVG6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Carm1Q9WVG6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Carm1Q9WVG6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Carm1Q9WVG6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Carm1Q9WVG6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Carm1Q9WVG6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Carm1Q9WVG6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Carm1Q9WVG6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Carm1Q9WVG6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Carm1Q9WVG6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Carm1Q9WVG6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carm1Q9WVG6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carm1Q9WVG6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carm1Q9WVG6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carm1Q9WVG6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carm1Q9WVG6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carm1Q9WVG6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carm1Q9WVG6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carm1Q9WVG6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carm1Q9WVG6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Carm1Q9WVG6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Carm1Q9WVG6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Carm1Q9WVG6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Carm1Q9WVG6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carm1Q9WVG6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carm1Q9WVG6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carm1Q9WVG6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Carm1Q9WVG6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carm1Q9WVG6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carm1Q9WVG6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carm1Q9WVG6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Carm1Q9WVG6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carm1Q9WVG6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Carm1Q9WVG6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Carm1Q9WVG6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carm1Q9WVG6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carm1Q9WVG6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carm1Q9WVG6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carm1Q9WVG6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carm1Q9WVG6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carm1Q9WVG6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carm1Q9WVG6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Carm1Q9WVG6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carm1Q9WVG6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carm1Q9WVG6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carm1Q9WVG6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carm1Q9WVG6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carm1Q9WVG6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Carm1Q9WVG6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carm1Q9WVG6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carm1Q9WVG6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carm1Q9WVG6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carm1Q9WVG6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carm1Q9WVG6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carm1Q9WVG6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Carm1Q9WVG6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Carm1Q9WVG6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Carm1Q9WVG6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Carm1Q9WVG6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Carm1Q9WVG6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Carm1Q9WVG6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carm1Q9WVG6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carm1Q9WVG6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carm1Q9WVG6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carm1Q9WVG6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Carm1Q9WVG6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Carm1Q9WVG6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Carm1Q9WVG6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Carm1Q9WVG6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carm1Q9WVG6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carm1Q9WVG6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carm1Q9WVG6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carm1Q9WVG6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carm1Q9WVG6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms