Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn5Q9WVD4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn5Q9WVD4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn5Q9WVD4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clcn5Q9WVD4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn5Q9WVD4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn5Q9WVD4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn5Q9WVD4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn5Q9WVD4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn5Q9WVD4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn5Q9WVD4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn5Q9WVD4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clcn5Q9WVD4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clcn5Q9WVD4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clcn5Q9WVD4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clcn5Q9WVD4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clcn5Q9WVD4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clcn5Q9WVD4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clcn5Q9WVD4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clcn5Q9WVD4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Clcn5Q9WVD4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clcn5Q9WVD4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clcn5Q9WVD4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clcn5Q9WVD4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clcn5Q9WVD4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clcn5Q9WVD4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clcn5Q9WVD4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clcn5Q9WVD4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clcn5Q9WVD4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clcn5Q9WVD4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Clcn5Q9WVD4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clcn5Q9WVD4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clcn5Q9WVD4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Clcn5Q9WVD4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcn5Q9WVD4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcn5Q9WVD4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcn5Q9WVD4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcn5Q9WVD4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Clcn5Q9WVD4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Clcn5Q9WVD4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clcn5Q9WVD4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clcn5Q9WVD4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clcn5Q9WVD4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clcn5Q9WVD4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clcn5Q9WVD4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcn5Q9WVD4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcn5Q9WVD4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn5Q9WVD4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn5Q9WVD4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn5Q9WVD4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn5Q9WVD4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn5Q9WVD4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn5Q9WVD4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clcn5Q9WVD4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clcn5Q9WVD4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn5Q9WVD4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Clcn5Q9WVD4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn5Q9WVD4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn5Q9WVD4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn5Q9WVD4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn5Q9WVD4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn5Q9WVD4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn5Q9WVD4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn5Q9WVD4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn5Q9WVD4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Clcn5Q9WVD4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn5Q9WVD4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn5Q9WVD4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn5Q9WVD4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn5Q9WVD4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn5Q9WVD4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn5Q9WVD4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn5Q9WVD4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn5Q9WVD4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clcn5Q9WVD4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn5Q9WVD4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn5Q9WVD4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn5Q9WVD4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn5Q9WVD4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn5Q9WVD4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn5Q9WVD4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn5Q9WVD4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clcn5Q9WVD4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clcn5Q9WVD4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clcn5Q9WVD4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn5Q9WVD4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn5Q9WVD4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn5Q9WVD4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn5Q9WVD4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Clcn5Q9WVD4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clcn5Q9WVD4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clcn5Q9WVD4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clcn5Q9WVD4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clcn5Q9WVD4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clcn5Q9WVD4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clcn5Q9WVD4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clcn5Q9WVD4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clcn5Q9WVD4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clcn5Q9WVD4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clcn5Q9WVD4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms