Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUT3

Rps6ka2, Ribosomal protein S6 kinase alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka2Q9WUT3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps6ka2Q9WUT3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps6ka2Q9WUT3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka2Q9WUT3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka2Q9WUT3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka2Q9WUT3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka2Q9WUT3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka2Q9WUT3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka2Q9WUT3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka2Q9WUT3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka2Q9WUT3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka2Q9WUT3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka2Q9WUT3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka2Q9WUT3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka2Q9WUT3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka2Q9WUT3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka2Q9WUT3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka2Q9WUT3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps6ka2Q9WUT3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rps6ka2Q9WUT3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps6ka2Q9WUT3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rps6ka2Q9WUT3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rps6ka2Q9WUT3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps6ka2Q9WUT3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps6ka2Q9WUT3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps6ka2Q9WUT3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6ka2Q9WUT3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6ka2Q9WUT3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6ka2Q9WUT3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms