Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUF2

Egr4, Early growth response protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr4Q9WUF2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Egr4Q9WUF2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Egr4Q9WUF2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Egr4Q9WUF2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Egr4Q9WUF2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms