Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUC3

Ly6h, Lymphocyte antigen 6H, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6hQ9WUC3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15,62■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15,62■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,62■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,61■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,61■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,61■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,61■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15,61■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,61■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,6■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15,6■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,6■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,6■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,6■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,6■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,6■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,6■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,59■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,59■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15,59■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,59■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15,59■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15,59■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,59■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,59■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,58■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15,58■□□□□ 0,09
Ly6hQ9WUC3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,58■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,58■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,58■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,58■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,58■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15,58■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15,57■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,57■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15,57■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15,56■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,56■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,56■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15,56■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,55■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,55■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,55■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15,55■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15,54■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15,53■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,53■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15,52■□□□□ 0,08
Ly6hQ9WUC3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,07
Ly6hQ9WUC3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,07
Ly6hQ9WUC3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,07
Ly6hQ9WUC3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Ly6hQ9WUC3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Ly6hQ9WUC3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Ly6hQ9WUC3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Ly6hQ9WUC3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Ly6hQ9WUC3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
Ly6hQ9WUC3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15,5■□□□□ 0,07
Ly6hQ9WUC3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
Ly6hQ9WUC3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,5■□□□□ 0,07
Ly6hQ9WUC3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
Ly6hQ9WUC3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,49■□□□□ 0,07
Ly6hQ9WUC3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,49■□□□□ 0,07
Ly6hQ9WUC3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,49■□□□□ 0,07
Ly6hQ9WUC3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,49■□□□□ 0,07
Ly6hQ9WUC3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15,49■□□□□ 0,07
Ly6hQ9WUC3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,2 ms