Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CcsQ9WU84 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CcsQ9WU84 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CcsQ9WU84 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CcsQ9WU84 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CcsQ9WU84 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CcsQ9WU84 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CcsQ9WU84 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CcsQ9WU84 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CcsQ9WU84 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CcsQ9WU84 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CcsQ9WU84 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CcsQ9WU84 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CcsQ9WU84 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CcsQ9WU84 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CcsQ9WU84 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CcsQ9WU84 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CcsQ9WU84 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CcsQ9WU84 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CcsQ9WU84 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CcsQ9WU84 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms