Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lhx6Q9R1R0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lhx6Q9R1R0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lhx6Q9R1R0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lhx6Q9R1R0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lhx6Q9R1R0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lhx6Q9R1R0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lhx6Q9R1R0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lhx6Q9R1R0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lhx6Q9R1R0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lhx6Q9R1R0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lhx6Q9R1R0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lhx6Q9R1R0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lhx6Q9R1R0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lhx6Q9R1R0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lhx6Q9R1R0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lhx6Q9R1R0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lhx6Q9R1R0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lhx6Q9R1R0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lhx6Q9R1R0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lhx6Q9R1R0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lhx6Q9R1R0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms