Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cry2Q9R194 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cry2Q9R194 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cry2Q9R194 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cry2Q9R194 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cry2Q9R194 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cry2Q9R194 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cry2Q9R194 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cry2Q9R194 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cry2Q9R194 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cry2Q9R194 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cry2Q9R194 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cry2Q9R194 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cry2Q9R194 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cry2Q9R194 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cry2Q9R194 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cry2Q9R194 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cry2Q9R194 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cry2Q9R194 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cry2Q9R194 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cry2Q9R194 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cry2Q9R194 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cry2Q9R194 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cry2Q9R194 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cry2Q9R194 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cry2Q9R194 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cry2Q9R194 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cry2Q9R194 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cry2Q9R194 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cry2Q9R194 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cry2Q9R194 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cry2Q9R194 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cry2Q9R194 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cry2Q9R194 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cry2Q9R194 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cry2Q9R194 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cry2Q9R194 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cry2Q9R194 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cry2Q9R194 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cry2Q9R194 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cry2Q9R194 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cry2Q9R194 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cry2Q9R194 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cry2Q9R194 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cry2Q9R194 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cry2Q9R194 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cry2Q9R194 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cry2Q9R194 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cry2Q9R194 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cry2Q9R194 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cry2Q9R194 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cry2Q9R194 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cry2Q9R194 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cry2Q9R194 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cry2Q9R194 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cry2Q9R194 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cry2Q9R194 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cry2Q9R194 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cry2Q9R194 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cry2Q9R194 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cry2Q9R194 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cry2Q9R194 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cry2Q9R194 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cry2Q9R194 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cry2Q9R194 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cry2Q9R194 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cry2Q9R194 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cry2Q9R194 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cry2Q9R194 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cry2Q9R194 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cry2Q9R194 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cry2Q9R194 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cry2Q9R194 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cry2Q9R194 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cry2Q9R194 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cry2Q9R194 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cry2Q9R194 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms