Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nr4a3Q9QZB6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr4a3Q9QZB6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr4a3Q9QZB6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr4a3Q9QZB6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr4a3Q9QZB6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr4a3Q9QZB6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr4a3Q9QZB6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr4a3Q9QZB6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr4a3Q9QZB6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr4a3Q9QZB6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr4a3Q9QZB6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr4a3Q9QZB6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr4a3Q9QZB6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr4a3Q9QZB6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr4a3Q9QZB6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr4a3Q9QZB6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr4a3Q9QZB6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr4a3Q9QZB6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr4a3Q9QZB6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr4a3Q9QZB6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr4a3Q9QZB6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nr4a3Q9QZB6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nr4a3Q9QZB6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr4a3Q9QZB6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr4a3Q9QZB6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms