Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22,27■■□□□ 1,16
Vps29Q9QZ88 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Vps29Q9QZ88 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Vps29Q9QZ88 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Vps29Q9QZ88 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Vps29Q9QZ88 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Vps29Q9QZ88 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Vps29Q9QZ88 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22,25■■□□□ 1,15
Vps29Q9QZ88 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,24■■□□□ 1,15
Vps29Q9QZ88 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22,24■■□□□ 1,15
Vps29Q9QZ88 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22,24■■□□□ 1,15
Vps29Q9QZ88 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,24■■□□□ 1,15
Vps29Q9QZ88 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Vps29Q9QZ88 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Vps29Q9QZ88 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Vps29Q9QZ88 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Vps29Q9QZ88 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Vps29Q9QZ88 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22,23■■□□□ 1,15
Vps29Q9QZ88 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Vps29Q9QZ88 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22,22■■□□□ 1,15
Vps29Q9QZ88 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Vps29Q9QZ88 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Vps29Q9QZ88 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Vps29Q9QZ88 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Vps29Q9QZ88 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Vps29Q9QZ88 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Vps29Q9QZ88 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Vps29Q9QZ88 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Vps29Q9QZ88 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Vps29Q9QZ88 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Vps29Q9QZ88 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Vps29Q9QZ88 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Vps29Q9QZ88 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Vps29Q9QZ88 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22,17■■□□□ 1,14
Vps29Q9QZ88 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22,16■■□□□ 1,14
Vps29Q9QZ88 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22,16■■□□□ 1,14
Vps29Q9QZ88 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Vps29Q9QZ88 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,14■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22,14■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22,12■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22,12■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22,11■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Vps29Q9QZ88 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,06■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22,04■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22,03■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,02■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Vps29Q9QZ88 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,11
Vps29Q9QZ88 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Vps29Q9QZ88 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,01■■□□□ 1,11
Vps29Q9QZ88 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22■■□□□ 1,11
Vps29Q9QZ88 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Vps29Q9QZ88 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Vps29Q9QZ88 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
Vps29Q9QZ88 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Vps29Q9QZ88 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Vps29Q9QZ88 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Vps29Q9QZ88 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Vps29Q9QZ88 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21,98■■□□□ 1,11
Vps29Q9QZ88 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Vps29Q9QZ88 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms