Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Bcl11aQ9QYE3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Bcl11aQ9QYE3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Bcl11aQ9QYE3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Bcl11aQ9QYE3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Bcl11aQ9QYE3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Bcl11aQ9QYE3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Bcl11aQ9QYE3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Bcl11aQ9QYE3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Bcl11aQ9QYE3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Bcl11aQ9QYE3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Bcl11aQ9QYE3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Bcl11aQ9QYE3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Bcl11aQ9QYE3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Bcl11aQ9QYE3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Bcl11aQ9QYE3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Bcl11aQ9QYE3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Bcl11aQ9QYE3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Bcl11aQ9QYE3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Bcl11aQ9QYE3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,58■■■□□ 2,17
Bcl11aQ9QYE3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Bcl11aQ9QYE3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Bcl11aQ9QYE3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Bcl11aQ9QYE3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,52■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Bcl11aQ9QYE3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Bcl11aQ9QYE3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28,51■■■□□ 2,15
Bcl11aQ9QYE3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Bcl11aQ9QYE3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Bcl11aQ9QYE3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Bcl11aQ9QYE3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Bcl11aQ9QYE3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Bcl11aQ9QYE3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Bcl11aQ9QYE3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Bcl11aQ9QYE3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Bcl11aQ9QYE3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Bcl11aQ9QYE3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Bcl11aQ9QYE3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Bcl11aQ9QYE3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Bcl11aQ9QYE3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Bcl11aQ9QYE3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Bcl11aQ9QYE3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Bcl11aQ9QYE3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
Bcl11aQ9QYE3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Bcl11aQ9QYE3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Bcl11aQ9QYE3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Bcl11aQ9QYE3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Bcl11aQ9QYE3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Bcl11aQ9QYE3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Bcl11aQ9QYE3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Bcl11aQ9QYE3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Bcl11aQ9QYE3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Bcl11aQ9QYE3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Bcl11aQ9QYE3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Bcl11aQ9QYE3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Bcl11aQ9QYE3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Bcl11aQ9QYE3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Bcl11aQ9QYE3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Bcl11aQ9QYE3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Bcl11aQ9QYE3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Bcl11aQ9QYE3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Bcl11aQ9QYE3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Bcl11aQ9QYE3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Bcl11aQ9QYE3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Bcl11aQ9QYE3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Bcl11aQ9QYE3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Bcl11aQ9QYE3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Bcl11aQ9QYE3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Bcl11aQ9QYE3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Bcl11aQ9QYE3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Bcl11aQ9QYE3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Bcl11aQ9QYE3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Bcl11aQ9QYE3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Bcl11aQ9QYE3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Bcl11aQ9QYE3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Bcl11aQ9QYE3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Bcl11aQ9QYE3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Bcl11aQ9QYE3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Bcl11aQ9QYE3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,7 ms