Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Plxnb3Q9QY40 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Plxnb3Q9QY40 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Plxnb3Q9QY40 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Plxnb3Q9QY40 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Plxnb3Q9QY40 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Plxnb3Q9QY40 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Plxnb3Q9QY40 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Plxnb3Q9QY40 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Plxnb3Q9QY40 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Plxnb3Q9QY40 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Plxnb3Q9QY40 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Plxnb3Q9QY40 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Plxnb3Q9QY40 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Plxnb3Q9QY40 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Plxnb3Q9QY40 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Plxnb3Q9QY40 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Plxnb3Q9QY40 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Plxnb3Q9QY40 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Plxnb3Q9QY40 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Plxnb3Q9QY40 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Plxnb3Q9QY40 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Plxnb3Q9QY40 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Plxnb3Q9QY40 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Plxnb3Q9QY40 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Plxnb3Q9QY40 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Plxnb3Q9QY40 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Plxnb3Q9QY40 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Plxnb3Q9QY40 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Plxnb3Q9QY40 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Plxnb3Q9QY40 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Plxnb3Q9QY40 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Plxnb3Q9QY40 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Plxnb3Q9QY40 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Plxnb3Q9QY40 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Plxnb3Q9QY40 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Plxnb3Q9QY40 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Plxnb3Q9QY40 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Plxnb3Q9QY40 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Plxnb3Q9QY40 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Plxnb3Q9QY40 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Plxnb3Q9QY40 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Plxnb3Q9QY40 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Plxnb3Q9QY40 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Plxnb3Q9QY40 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Plxnb3Q9QY40 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Plxnb3Q9QY40 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Plxnb3Q9QY40 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Plxnb3Q9QY40 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Plxnb3Q9QY40 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Plxnb3Q9QY40 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Plxnb3Q9QY40 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Plxnb3Q9QY40 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Plxnb3Q9QY40 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plxnb3Q9QY40 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plxnb3Q9QY40 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plxnb3Q9QY40 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Plxnb3Q9QY40 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Plxnb3Q9QY40 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Plxnb3Q9QY40 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Plxnb3Q9QY40 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Plxnb3Q9QY40 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Plxnb3Q9QY40 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Plxnb3Q9QY40 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Plxnb3Q9QY40 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Plxnb3Q9QY40 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Plxnb3Q9QY40 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Plxnb3Q9QY40 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Plxnb3Q9QY40 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Plxnb3Q9QY40 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Plxnb3Q9QY40 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Plxnb3Q9QY40 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Plxnb3Q9QY40 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Plxnb3Q9QY40 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Plxnb3Q9QY40 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Plxnb3Q9QY40 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Plxnb3Q9QY40 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms