Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mid2Q9QUS6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mid2Q9QUS6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mid2Q9QUS6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mid2Q9QUS6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mid2Q9QUS6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mid2Q9QUS6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mid2Q9QUS6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mid2Q9QUS6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mid2Q9QUS6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mid2Q9QUS6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mid2Q9QUS6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mid2Q9QUS6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mid2Q9QUS6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mid2Q9QUS6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mid2Q9QUS6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mid2Q9QUS6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mid2Q9QUS6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mid2Q9QUS6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mid2Q9QUS6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mid2Q9QUS6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms