Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upk3aQ9JKX8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upk3aQ9JKX8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upk3aQ9JKX8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upk3aQ9JKX8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upk3aQ9JKX8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upk3aQ9JKX8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upk3aQ9JKX8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upk3aQ9JKX8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upk3aQ9JKX8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upk3aQ9JKX8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upk3aQ9JKX8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Upk3aQ9JKX8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Upk3aQ9JKX8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Upk3aQ9JKX8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upk3aQ9JKX8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upk3aQ9JKX8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Upk3aQ9JKX8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upk3aQ9JKX8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upk3aQ9JKX8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upk3aQ9JKX8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upk3aQ9JKX8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upk3aQ9JKX8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upk3aQ9JKX8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upk3aQ9JKX8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upk3aQ9JKX8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upk3aQ9JKX8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upk3aQ9JKX8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upk3aQ9JKX8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Upk3aQ9JKX8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Upk3aQ9JKX8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Upk3aQ9JKX8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Upk3aQ9JKX8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Upk3aQ9JKX8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upk3aQ9JKX8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upk3aQ9JKX8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upk3aQ9JKX8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upk3aQ9JKX8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upk3aQ9JKX8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upk3aQ9JKX8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upk3aQ9JKX8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upk3aQ9JKX8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upk3aQ9JKX8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upk3aQ9JKX8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upk3aQ9JKX8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upk3aQ9JKX8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Upk3aQ9JKX8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upk3aQ9JKX8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upk3aQ9JKX8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upk3aQ9JKX8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upk3aQ9JKX8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upk3aQ9JKX8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upk3aQ9JKX8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upk3aQ9JKX8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upk3aQ9JKX8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Upk3aQ9JKX8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Upk3aQ9JKX8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms