Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arl6ip1Q9JKW0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arl6ip1Q9JKW0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Arl6ip1Q9JKW0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arl6ip1Q9JKW0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arl6ip1Q9JKW0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms