Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufaf3Q9JKL4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufaf3Q9JKL4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufaf3Q9JKL4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms