Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stx6Q9JKK1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stx6Q9JKK1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stx6Q9JKK1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stx6Q9JKK1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stx6Q9JKK1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stx6Q9JKK1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stx6Q9JKK1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stx6Q9JKK1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stx6Q9JKK1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stx6Q9JKK1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stx6Q9JKK1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stx6Q9JKK1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stx6Q9JKK1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stx6Q9JKK1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stx6Q9JKK1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stx6Q9JKK1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stx6Q9JKK1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Stx6Q9JKK1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Stx6Q9JKK1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Stx6Q9JKK1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stx6Q9JKK1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stx6Q9JKK1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stx6Q9JKK1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stx6Q9JKK1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stx6Q9JKK1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Stx6Q9JKK1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Stx6Q9JKK1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stx6Q9JKK1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stx6Q9JKK1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stx6Q9JKK1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stx6Q9JKK1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stx6Q9JKK1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stx6Q9JKK1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Stx6Q9JKK1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stx6Q9JKK1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stx6Q9JKK1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stx6Q9JKK1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stx6Q9JKK1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stx6Q9JKK1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stx6Q9JKK1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stx6Q9JKK1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stx6Q9JKK1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stx6Q9JKK1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stx6Q9JKK1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stx6Q9JKK1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stx6Q9JKK1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stx6Q9JKK1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stx6Q9JKK1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stx6Q9JKK1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stx6Q9JKK1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stx6Q9JKK1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stx6Q9JKK1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stx6Q9JKK1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stx6Q9JKK1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stx6Q9JKK1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stx6Q9JKK1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stx6Q9JKK1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stx6Q9JKK1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stx6Q9JKK1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stx6Q9JKK1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stx6Q9JKK1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Stx6Q9JKK1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stx6Q9JKK1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stx6Q9JKK1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stx6Q9JKK1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stx6Q9JKK1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stx6Q9JKK1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stx6Q9JKK1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stx6Q9JKK1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stx6Q9JKK1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stx6Q9JKK1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stx6Q9JKK1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stx6Q9JKK1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stx6Q9JKK1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stx6Q9JKK1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stx6Q9JKK1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stx6Q9JKK1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stx6Q9JKK1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stx6Q9JKK1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stx6Q9JKK1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stx6Q9JKK1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stx6Q9JKK1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stx6Q9JKK1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stx6Q9JKK1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stx6Q9JKK1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stx6Q9JKK1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stx6Q9JKK1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stx6Q9JKK1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stx6Q9JKK1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stx6Q9JKK1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stx6Q9JKK1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stx6Q9JKK1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stx6Q9JKK1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stx6Q9JKK1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stx6Q9JKK1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Stx6Q9JKK1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Stx6Q9JKK1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Stx6Q9JKK1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Stx6Q9JKK1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms